用于产前诊断的羊水细胞RNA测序
香港大学(HKUMed)的临床研究团队使用在怀孕 16-24 周期间获得的羊水细胞作为一种新的样本类型,用于产前诊断中的 RNA 测序,以帮助更多家庭进行量身定制的临床管理。这是第一个证明羊水细胞 RNA 测序潜在临床效用的概念验证研究。该研究结果已发表在npj Genomic Medicine 杂志上。
罕见病通常起源于遗传。根据该团队之前的研究,虽然个体罕见,但集体罕见疾病在香港人口中的发病率为 67 分之一。鉴定罕见病的遗传原因可以为更好的临床管理和未来的妊娠计划提供准确的咨询,这对支持患者至关重要。目前的产前诊断技术主要基于 DNA,其中很大一部分 (60-70%) 仍未确诊,导致临床不确定性和父母焦虑。
最近,发现 RNA 测序可将诊断率提高 10% 至 36%;然而,这些研究都没有关注产前诊断。此外,尽管有完善的大型数据库对成人不同组织的基因表达谱进行编目,但缺乏类似的反映胚胎和胎儿阶段的羊水细胞公开数据集。因此,有必要对产前环境中的 RNA 测序进行进一步的研究和研究。
研究小组展示了羊水细胞 RNA 测序的潜在临床效用。通过对 50 多个羊水样本进行 RNA 测序,建立了羊水细胞基因表达谱的基线。建立基因表达谱是将 RNA 测序应用于当前选定的临床诊断工作流程的重要步骤。
研究人员发现,羊水细胞中表达良好的基因数量与通常用于不同疾病类别基因诊断的其他临床可及组织相当。研究小组还将 4 个具有先天性结构异常的受影响胎儿的 RNA 测序数据与既定基线进行了比较,以检测潜在的异常值。
与德国慕尼黑工业大学合作,对生物信息学管道进行了调整,以增强对异常值的检测以进行后续分析。进一步的深入研究表明,在所有四个受影响的胎儿中,可以在与相应结构先天性异常相关的基因中识别出异常值。识别异常值可以在 RNA 水平上提供更多证据来帮助诊断。
这项研究的结果对解决香港未确诊的罕见病具有重要意义。这是文献中首次报道羊水细胞RNA 测序在产前诊断中具有潜在的临床应用价值。通过确定遗传原因,可以进行精准医疗,例如针对有家族史的家庭进行量身定制的临床管理和植入前遗传学诊断。