曲式上：两者都采用奏鸣曲式，但贝多芬使之大大扩充发展，并且赋予了深刻的内涵。

2. 结构上：莫扎特采用的是海顿的古典式的三乐章或四乐章结构，小巧玲珑，规范精致。

贝多芬保留了古典四乐章形式，但把第三乐章的“小步舞曲式”改为悲壮深刻的“诙谐曲”（名称上如此称呼而已，其实并不幽默诙谐）；首度创作了五乐章的《田园交响曲》，并赋予每个乐章一个小标题；音乐史上第一次在交响乐中引入人声（《合唱交响曲》）。

3. 配器上：莫扎特使用了十八世纪后半叶的交响乐队一般采用的双管编制，即长笛、双簧管、单簧管、大管、法国号和小号各两只（有时他连这样的乐队编制都没全部采用），这样的编制特点使音乐的音响格外纯净，透明而富有表情，如同使乐器发出人的声音一般。

贝多芬的交响曲使用的乐队以完整的双管编制为基础。

木管方面，本来在海顿和莫扎特的交响曲中还难得看到的单簧管已经确立了他的牢固地位，铜管乐器声部不用长号，由两个法国号和两个小号组成。

他只是在个别交响曲中，才添加了短笛、低音大管和长号，在《第九（合唱）交响曲》中甚至用到四个长号。

他很重视木管乐器，让它演奏十分重要的声部，他的《第一交响曲》已经明显表露出这个特点。

值得注意的是：由于配器上的不同处理，他的《第一交响曲》和《第七交响曲》虽然都是双管编制，但其音响效果却迥然不同。

4. 精神内涵上：由于莫扎特的交响乐创作时间跨度较长，所以很难找出其中同一的精神线索。

然而莫扎特的交响曲虽然有时具有一些悲剧性因素，但更多的是抒情歌唱，灵动活泼，调皮嬉戏。

贝多芬则把英雄的主题放在他的交响曲中的首位，赋予他所表现的英雄以哲学家与战士的品格和思想家的头脑。

他所塑造的英雄生活在人民中间，把为人民争取自由作为生活的目的，他为实现正义的事业而奋斗，他在同敌对势力的斗争中甚至牺牲了自己，直至赢得了斗争的胜利。

贝多芬曾说过：“我们的时代需要精神健壮的人物。

”因此，我们可以打这样一个比方：莫扎特是少年维特，贝多芬是埃格蒙特；莫扎特是调皮的苏珊娜，贝多芬则是勇敢的列奥诺拉；莫扎特是机智的费加罗，而贝多芬则是革命斗争的英雄 .莫扎特写了17部钢琴奏鸣曲、6部小提琴奏鸣曲和35部钢琴小提琴奏鸣曲等，对古典奏鸣曲套曲的发展有一定的贡献，确立了维也纳古典乐派3个乐章的奏鸣曲套曲形式。

在钢琴奏鸣曲方面，他完成了从哈普西科德风格到钢琴风格的过渡。

在他80年代的钢琴奏鸣曲中，已使钢琴的效果和音域得到了发挥，如《A大调钢琴奏鸣曲》（1783）《c小调奏鸣曲》（1785）等。

前者体现了他的生活风俗性的特点，后者显示了尖锐的对比并置与戏剧性的力量，预示了贝多芬钢琴奏鸣曲的诞生。

莫扎特的钢琴小提琴奏鸣曲，从意大利A.科雷利G.B.萨马蒂尼等人的影响中逐步解放出来，形成了自己独立的风格。

从1778年开始，莫扎特就将钢琴和小提琴两件乐器摆在同等重要的地位，如降E大调（1781）、降B大调（1784）、降E大调（1785）、A大调（1787）等几首都较成功。